Il Museo della Città ospita al suo interno opere e reperti di elevato valore storico e artistico.
Una parte dei materiali affidati al Museo compone il percorso espositivo permanente che offre una visone generale delle principali tematiche della storia di Mantova e del suo territorio.

Le altre collezioni, anch'esse di grande pregio, sono conservate dal Museo per essere esposte al pubblico in occasione di mostre temporanee.